Der Vorstand besteht aus sieben Mitgliedern, welche von der Mitgliederversammlung gewählt werden. Er bestimmt auf Antrag der Geschäftsleitung und der Kursleiterinnen die Fernziele der agfam und die jährlichen Angebote.

An der jährlichen Generalversammlung können die Mitglieder ihre Ideen und Wünsche einbringen.

Mitglieder der agfam können Apothekenmitarbeitende sein. Als solche gelten Apothekerinnen und Apotheker, sowie Pharma-Assistentinnen und Pharma-Assistenten.